При обновлении некоторых пакетов может потребоваться вручную обновить их конфиги. Если после установки какого-либо пакета вы видите на экране такое сообщение:

 * IMPORTANT: 2 config files in '...' need updating.

значит некоторые конфиги ждут своего обновления. Обновить их можно либо с помощью etc-update, либо с помощью dispatch-conf. Рекомендуется использовать вторую команду, как более мощную, а при соответствующей настройке, умеющую сохранять историю изменений. В любом случае здесь рекомендуется включать мозг и внимательно изучать, какие строчки будут удалены, а какие – добавлены. Если обновляется какой-либо конфиг, где вы вносили свои корректировки, они могут быть предложены к удалению – поэтому нужно быть внимательным (сам по-первости попался – обновил конфиги не глядя, а потом удивлялся, почему настройки, которые я терпеливо прописывал в несколько файлов вдруг заменились на дефолтные).